Diagnostica avanzata microbiologica traslazionale
La struttura complessa con funzione di ricerca denominata "Diagnostica Avanzata Microbiologica Traslazionale":
- funge da Laboratorio di riferimento del Friuli Venezia - Giulia nell'ambito della rete sentinella dell’Istituto Superiore di Sanità (ISS)
- è il Centro microbiologico di riferimento della III Commissione del Consiglio Superiore del Ministero della Salute per la sorveglianza delle Infezioni Sessualmente Trasmesse (IST)
- è il Centro materno-infantile di riferimento del Friuli Venezia - Giulia per Covid-19 in collaborazione con ISS.
- è la sede universitaria dell'Università degli Studi di Trieste (UNITS) per la Scuola di Specializzazione in Microbiologia e Virologia
Le attività della struttura si configurano all’interno delle finalità istituzionali dell’IRCCS Burlo garofolo e dell’Università degli Studi di Trieste, con funzioni assistenziali, di ricerca biomedica traslazionale, di avanzamento tecnologico e didattica.
Il “core” della struttura si basa sull’ approccio multidisciplinare integrato per affrontare i vari aspetti etio-patogenetici delle IST, dei dismicrobismi dell’ospite e delle infezioni respiratorie emergenti, attraverso il trasferimento nella diagnostica delle attuali conoscenze della ricerca scientifica e tecnologica.
Il laboratorio è altresì impegnato nella lotta all’ antibiotico resistenza e del suo impatto sul paziente ospedalizzato attraverso sistemi “green” di ultima generazione e tecnologie “omiche” per la disinfezione e il monitoraggio del microbioma e resistoma microbiologico dell’ ambientale ospedaliero.
Il team di professionisti è attivamente impegnato in campo Ostetrico Ginecologico, Procreazione Medicalmente Assistita, Urologia, Pediatria, centri MST, Direzione Sanitaria.
La struttura svolge le seguenti funzioni:
- Diagnosi molecolare di infezioni sessualmente trasmesse (IST)
- Caratterizzazione genotipica delle resistenze farmacologiche per le IST
- Caratterizzazione del microbioma vaginale, intestinale, urinario, orale
- Diagnosi di infezioni respiratorie emergenti in pediatria
- Diagnosi per infezione da Covid-19
- Sorveglianza epidemiologica della diffusione delle IST a livello locale e nazionale
- Sorveglianza e monitoraggio delle infezioni ospedaliere comprese le resistenze agli antibiotici.
- Controlli di qualità esterni nazionali ed europei (QCMD, UKNEQUAS) per ognuna delle infezioni contemplate nell’offerta diagnostica
- Counselling microbiologico
- Attività didattica per lauree triennali e a ciclo unico, corsi di dottorato e master, scuole di specializzazione
- Attività di ricerca traslazionale
- Attività di Informazione e Formazione di personale sanitario
La struttura e' sede regionale della Scuola di Specializzazione in Microbiologia e Virologia e accoglie studenti della scuola di Dottorato in Scienze della Riproduzione e dello Sviluppo dell'Universita' degli Studi di Trieste.
Ospita studenti di Medicina e Chirurgia, Genomica Funzionale, Biotecnologie Mediche, Tecniche di Laboratorio Biomedico, Scienze e Tecnologie Biologiche per tirocini e tesi di laurea.
ll personale strutturato universitario svolge attività didattica e tutoraggio nel settore scientifico disciplinare Med/06 -Microbiologia clinica- per i corsi di Laurea in Medicina, Odontoiatria, Igienisti dentali, Tecnici della Prevenzione, Infermieri, Ostetriche, Tecnici di laboratorio Biomedico. Svolge attivita' formativa e didattica per le Scuole di Specializzazione Mediche e Master di I e II livello dell’Università diegli Studi di Trieste.
Attività di ricerca
L’attività di ricerca è volta allo studio.
In particolare sono in atto studi nell’ambito delle seguenti aree di ricerca:
- Studio dei dismicrobismi vaginali in tema di infertilità idiopatica, vaginosi e vaginite batterica e candidosi ricorrente
- Ruolo del microbioma intestinale nell’obesità e dopo trattamento con chirurgia bariatrica
- Identificazione di marcatori solubili di infiammazione in risposta ai dismicrobismi
- Applicazione di tecnologie omiche per il monitoraggio del microbioma ambientale in ambito ospedaliero e colonizzazione del paziente
- Studio del resistoma ambientale come sistema allert per la lotta all'antibiotico resistenza
- Studio della risposta immune all'infezione da Covid-19 in eta' pediatrica
- Studio dell'impatto dell'infezione da Covid-19 sulla salute riproduttiva della donna
Collaborazioni
IARC, Lyon, France
Baylor College of Medicine, Houston ,TX
King College of London, London, UK
Istituto Superiore di Sanita', Roma, Italy
- Laboratorio di riferimento regionale della rete sentinella per la sorveglianza della diffusione delle infezioni CHlamidya T, Neisseria Gonorreahe, Tricomonas vaginalis dell’ Istituto Superiore di Sanita'.
- Centro microbiologico di riferimento per la gestione IST della III Comissione del Consiglio Superiore del Ministero della Salute.
- Laboratorio di riferimento per la diagnosi di Covid-19 per pazienti pediatrici e gravide.
- Centro per l’analisi dei dismicrobismi di origine batterica correlate a patologia con tecniche di Next generation Sequencing
- Lotta all'antibiotico resistenza in ambiente ospedaliero con tecnologie Green